Считается, что древняя река Томь протекала в этом месте на 20-30 км. западнее, по руслу речки Мунгат. Интенсивно размывая Ажендаровский хребет (Тарадановский увал) она образовала россыпи агата в районе современных деревень Ключи и Арсеново, вплоть  до поселка Крапивинский. Цельное проявление серо-голубых агатов обнаружено в верховьях  Мунгата, там, где в него впадает речка Березовка

Древние кочевые народы не обходили поселок стороной. На территории поселка и рядом с ним обнаружены места их стоянок. Так, в 1962 году, на берегу Томи, на холме в полукилометре от поселка, Мартыновым и Бородкиным была открыта неолитическая стоянка.